Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms