Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms