Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FRMPD1Q5SYB0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FRMPD1Q5SYB0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
FRMPD1Q5SYB0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FRMPD1Q5SYB0 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
FRMPD1Q5SYB0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FRMPD1Q5SYB0 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FRMPD1Q5SYB0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FRMPD1Q5SYB0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FRMPD1Q5SYB0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FRMPD1Q5SYB0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FRMPD1Q5SYB0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FRMPD1Q5SYB0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FRMPD1Q5SYB0 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FRMPD1Q5SYB0 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FRMPD1Q5SYB0 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FRMPD1Q5SYB0 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FRMPD1Q5SYB0 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FRMPD1Q5SYB0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FRMPD1Q5SYB0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FRMPD1Q5SYB0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FRMPD1Q5SYB0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FRMPD1Q5SYB0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FRMPD1Q5SYB0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FRMPD1Q5SYB0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
FRMPD1Q5SYB0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FRMPD1Q5SYB0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FRMPD1Q5SYB0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FRMPD1Q5SYB0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FRMPD1Q5SYB0 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FRMPD1Q5SYB0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FRMPD1Q5SYB0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
FRMPD1Q5SYB0 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
FRMPD1Q5SYB0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FRMPD1Q5SYB0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FRMPD1Q5SYB0 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FRMPD1Q5SYB0 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FRMPD1Q5SYB0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FRMPD1Q5SYB0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FRMPD1Q5SYB0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FRMPD1Q5SYB0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FRMPD1Q5SYB0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FRMPD1Q5SYB0 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FRMPD1Q5SYB0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
FRMPD1Q5SYB0 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
FRMPD1Q5SYB0 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
FRMPD1Q5SYB0 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
FRMPD1Q5SYB0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FRMPD1Q5SYB0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FRMPD1Q5SYB0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FRMPD1Q5SYB0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FRMPD1Q5SYB0 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms