Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms