Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP78Q5JTW2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms