Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAVIN4Q5BKX8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms