Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJD5

TMEM41B, Transmembrane protein 41B, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM41BQ5BJD5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM41BQ5BJD5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM41BQ5BJD5 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM41BQ5BJD5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM41BQ5BJD5 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM41BQ5BJD5 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM41BQ5BJD5 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM41BQ5BJD5 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM41BQ5BJD5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM41BQ5BJD5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM41BQ5BJD5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM41BQ5BJD5 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM41BQ5BJD5 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM41BQ5BJD5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM41BQ5BJD5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM41BQ5BJD5 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM41BQ5BJD5 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM41BQ5BJD5 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM41BQ5BJD5 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM41BQ5BJD5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM41BQ5BJD5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM41BQ5BJD5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM41BQ5BJD5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM41BQ5BJD5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM41BQ5BJD5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM41BQ5BJD5 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM41BQ5BJD5 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM41BQ5BJD5 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM41BQ5BJD5 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM41BQ5BJD5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM41BQ5BJD5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM41BQ5BJD5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM41BQ5BJD5 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM41BQ5BJD5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM41BQ5BJD5 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM41BQ5BJD5 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM41BQ5BJD5 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM41BQ5BJD5 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM41BQ5BJD5 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM41BQ5BJD5 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM41BQ5BJD5 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM41BQ5BJD5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM41BQ5BJD5 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM41BQ5BJD5 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM41BQ5BJD5 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM41BQ5BJD5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM41BQ5BJD5 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms