Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms