Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3G0

ABCB5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB5Q2M3G0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCB5Q2M3G0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCB5Q2M3G0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCB5Q2M3G0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCB5Q2M3G0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCB5Q2M3G0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCB5Q2M3G0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCB5Q2M3G0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCB5Q2M3G0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCB5Q2M3G0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCB5Q2M3G0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCB5Q2M3G0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCB5Q2M3G0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCB5Q2M3G0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCB5Q2M3G0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCB5Q2M3G0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCB5Q2M3G0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCB5Q2M3G0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCB5Q2M3G0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCB5Q2M3G0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCB5Q2M3G0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCB5Q2M3G0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCB5Q2M3G0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCB5Q2M3G0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB5Q2M3G0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms