Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ISXQ2M1V0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms