Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms