Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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