Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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