Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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ECM1Q16610 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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ECM1Q16610 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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ECM1Q16610 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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ECM1Q16610 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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