Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF239Q16600 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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