Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
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SGCAQ16586 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
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SGCAQ16586 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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SGCAQ16586 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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SGCAQ16586 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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SGCAQ16586 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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SGCAQ16586 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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