Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ACKR1Q16570 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms