Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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