Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZIC1Q15915 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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