Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6AP1Q15904 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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