Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms