Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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