Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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