Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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RFTN1Q14699 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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RFTN1Q14699 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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RFTN1Q14699 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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RFTN1Q14699 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFTN1Q14699 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
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