Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
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