Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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