Protein–RNA interactions for Protein: Q13686

ALKBH1, Nucleic acid dioxygenase ALKBH1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH1Q13686 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
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ALKBH1Q13686 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
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ALKBH1Q13686 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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ALKBH1Q13686 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALKBH1Q13686 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms