Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
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