Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX6Q13608 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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