Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRR1Q13601 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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