Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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UBE2V1Q13404 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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UBE2V1Q13404 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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UBE2V1Q13404 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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UBE2V1Q13404 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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UBE2V1Q13404 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2V1Q13404 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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