Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATMQ13315 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATMQ13315 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATMQ13315 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATMQ13315 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATMQ13315 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATMQ13315 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATMQ13315 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATMQ13315 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATMQ13315 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATMQ13315 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATMQ13315 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATMQ13315 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATMQ13315 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATMQ13315 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATMQ13315 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATMQ13315 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATMQ13315 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATMQ13315 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATMQ13315 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATMQ13315 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ATMQ13315 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ATMQ13315 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ATMQ13315 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ATMQ13315 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATMQ13315 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATMQ13315 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATMQ13315 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATMQ13315 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATMQ13315 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATMQ13315 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATMQ13315 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATMQ13315 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATMQ13315 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATMQ13315 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATMQ13315 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATMQ13315 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATMQ13315 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATMQ13315 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATMQ13315 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATMQ13315 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ATMQ13315 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATMQ13315 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATMQ13315 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ATMQ13315 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATMQ13315 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATMQ13315 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATMQ13315 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATMQ13315 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ATMQ13315 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ATMQ13315 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATMQ13315 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATMQ13315 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATMQ13315 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATMQ13315 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATMQ13315 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATMQ13315 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATMQ13315 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATMQ13315 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATMQ13315 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATMQ13315 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATMQ13315 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATMQ13315 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATMQ13315 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATMQ13315 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATMQ13315 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATMQ13315 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATMQ13315 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATMQ13315 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATMQ13315 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATMQ13315 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ATMQ13315 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATMQ13315 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATMQ13315 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ATMQ13315 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATMQ13315 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATMQ13315 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATMQ13315 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATMQ13315 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATMQ13315 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATMQ13315 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATMQ13315 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ATMQ13315 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATMQ13315 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ATMQ13315 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ATMQ13315 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATMQ13315 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATMQ13315 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATMQ13315 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATMQ13315 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATMQ13315 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATMQ13315 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATMQ13315 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATMQ13315 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATMQ13315 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATMQ13315 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATMQ13315 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATMQ13315 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATMQ13315 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATMQ13315 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
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