Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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SCGB2A2Q13296 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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SCGB2A2Q13296 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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SCGB2A2Q13296 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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SCGB2A2Q13296 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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SCGB2A2Q13296 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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SCGB2A2Q13296 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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SCGB2A2Q13296 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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SCGB2A2Q13296 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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SCGB2A2Q13296 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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SCGB2A2Q13296 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCGB2A2Q13296 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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SCGB2A2Q13296 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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