Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
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CLN3Q13286 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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CLN3Q13286 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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CLN3Q13286 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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CLN3Q13286 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
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