Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRSF5Q13243 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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