Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms