Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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