Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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