Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC30.61■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC30.59■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
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GRIN2AQ12879 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
GRIN2AQ12879 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
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