Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms