Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC33.4■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC33.39■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
HMGXB3Q12766 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC33.38■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC33.34■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
HMGXB3Q12766 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
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