Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBRQ0VD83 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms