Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms