Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SOX4Q06945 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SOX4Q06945 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SOX4Q06945 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SOX4Q06945 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SOX4Q06945 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SOX4Q06945 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SOX4Q06945 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SOX4Q06945 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SOX4Q06945 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SOX4Q06945 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SOX4Q06945 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SOX4Q06945 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SOX4Q06945 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SOX4Q06945 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SOX4Q06945 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SOX4Q06945 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SOX4Q06945 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SOX4Q06945 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SOX4Q06945 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SOX4Q06945 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SOX4Q06945 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SOX4Q06945 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SOX4Q06945 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SOX4Q06945 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SOX4Q06945 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SOX4Q06945 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SOX4Q06945 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SOX4Q06945 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SOX4Q06945 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SOX4Q06945 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SOX4Q06945 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SOX4Q06945 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SOX4Q06945 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SOX4Q06945 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SOX4Q06945 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SOX4Q06945 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms