Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms