Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB3Q05901 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms