Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKCDQ05655 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms