Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms