Protein–RNA interactions for Protein: Q03692

COL10A1, Collagen alpha-1(X) chain, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL10A1Q03692 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
COL10A1Q03692 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms