Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms